GEMM (Genetically Engineered & Mutant Mice)の多くの系統はコンジェニック系統であり、コンジェニック系統のマウスは、GEMMと呼ばれる。 先天性系統は、ある遺伝的背景から特定の近交系に突然変異を導入し、戻し交配を繰り返すことによって作出されるものである。 先天性系統と近交系系統は、移植された遺伝子座と連鎖した染色体部分を除くすべての遺伝子座で同一であることが期待される。 この染色体セグメントの大きさ、他の染色体への移入の可能性は戻し交配の世代数によって決まる。
自然変異や標的変異を持つコンジェニックマウス、および組織適合性遺伝子座のコンジェニックマウスの系統名のほとんどは、歴史的な理由から標準的なコンジェニック命名法に従っていない。 2000年6月1日より、多くのJAX®マウス系統名が、突然変異の起源となる系統を示すために変更されました。 JAX® Miceデータベースでは、系統名を新しい名称で表示し、旧名称を明記しています。 以下に、名称変更の例を示します。 コンジェニックは戻し交配の5世代目（N5）に達した系統を採用するが、N10までは完全なコンジェニックとは見なさない。 異なる起源に由来する複数の対立遺伝子を持ついくつかの系統については、その系統の作出方法から、あるいは命名法がさらなる混乱を引き起こすという理由から、命名法を変更しないことにした。 トランスジェニックや遺伝子変異の起源に関するその他の情報は、JAX® Mice Databaseで、目的の遺伝子記号や株番号で検索することができます。
Nomenclature of congenic strains
Congenic strainsは、宿主株（通常省略）、ピリオド、ドナー株（これも通常省略）、ハイフン、差動遺伝子座およびアレルの斜体記号からなる複合記号（例えば…）で指定される。 B10.129P-H12b)。 ドナー系統が近交系でない場合や複合系の場合は、コンジェニックを示す「Cg」という記号を用いる。 コンジェニック命名法は完全なコンジェニックと同様にインサイジェントにも適用されます。
多くのコンジェニックの遺伝的背景はC57BL/6Jと129亜種（B6;129, B6;129P, B6;129Sのいずれかを指定、後の「129系統マウスの命名法の改訂」の説明参照）の混合である。 しかし、いくつかのコンジェニック系統の背景は不明であり、2つ以上の前駆系統に由来し、あるいは不明またはアウトブリードソースからの遺伝的寄与があるものである。 このようなコンジェニックの背景は、しばしば “STOCK “と呼ばれる。 以前は、混合背景（例えば、B6;129またはSTOCKのいずれか）から近交系背景への戻し交配によって移されたほとんどの自然および誘導突然変異は、従来のコンジェニック命名法では記述されなかった。 しかし、多くのGenetically Engineered and Mutant Miceの系統名は、変異の由来をより明確に示すために改訂されています（例：B6.129P2-Apoetm1Unc/J）＜399＞ ＜518＞ジャクソン研究所では、多数の組織適合性コンジェニック系統を提供しています。 場合によっては、複数の系統が同じドナー系統に由来し、括弧内の数字や文字で区別されています（例：B10.129P-H11b（10M）/SnJ and B10.129P-H46b H47b（21M）/Sn）
2000年に、多くのJAX® Mice系統名が突然変異の由来系統を示すために変更されています。 名称変更の例
例1.
|
STRAIN NAME |
B6.129P2-Tcrbtm1Mom/J
Note: この系統名は、B6;129Pの混合遺伝子背景で維持される突然変異のものと混同してはならない。ここでは、名前の中の系統略語はピリオドではなくセミコロンで区切られている（例5を参照）。 遺伝的背景をより明確にするため、印刷物およびホームページの両方で、コンジェニック株詳細に追加情報（株の種類、コントロール情報、背景およびドナー株、世代番号）を記載しています。 例2.
Note.No: Cg（congenicの意）は、ドナー系統が複数ある場合や、ドナー系統の遺伝的背景が混在している場合に使用されます。 例3.
注：この例では、misty（m）コートカラーマーカーと糖尿病（Leprdb）突然変異が反発し合って維持されていることを示しながら、両方の突然変異がDBA/Jで生じたことを示唆しないためにCgを用いている。 例4.
Note: ドナー株の後の括弧内には、さらに寄与する遺伝物質が含まれる場合がある。 この例では、標的突然変異が混合B6;129Pバックグラウンドから第3の近交系に移された。 標的遺伝子に隣接するゲノム領域は、ES細胞株の由来から129P2様であるが、この株のゲノムの未知の量はC57BL/6由来である可能性がある。 差動遺伝子座に連結した、あるいは連結していないドナー株DNAの量は、戻し交配の世代が増えるにつれて減少する。 混合遺伝子背景で変異を導入した株 例5.
Note: これはコンジェニックではなく、C57BL/6と129P2（ES細胞株由来）の混合であるため、この2つの系統のアレルを分離している。 系統の略称の間のカンマは、コンジェニック命名法のピリオドと明確に区別するためにセミコロンに変更した。 命名法は変更しなかったが、異なる起源からの対立遺伝子を持つ系統 例 6.
注: 本系統は、C57BL/6J遺伝学的背景の上に、すでに差動対立遺伝子を持つ3個のコンジェニック系統を戻し交配ではなく、一緒に交配して作られたものである（B6.C-Igha、B6.PL-Thy1a、B6.CAST-Gpi1） である。 |
コメントを残す