În acest studiu am caracterizat diversitatea genetică și relațiile dintre populațiile musulmane Shia și Sunni din nordul Indiei și populațiile învecinate și globale vizate geografic. Am examinat o serie de parametri de interes genetic al populației și criminalistic pe baza frecvențelor alelelor din 15 loci STR autosomali (D8S1179, D21S11, D7S820, CSF1PO, D19S433, VWA, TPOX, D18S51, D3S1358, THO1, D13S317, D16S539, D2S1338, D5S818 și FGA). Toți loci studiați au fost în concordanță cu echilibrul Hardy-Weinberg, cu excepția locilor D18S51 și FGA pentru ambele populații musulmane, chiar și după aplicarea corecției Bonferroni. Valorile combinate ale puterii de excludere și ale puterii combinate de discriminare pentru toți cei 15 loci STR au fost de 0,9999 și, respectiv, >0,99999, în ambele populații musulmane. Valorile diversității genice au variat de la 0,6784 (TPOX) la 0,9027 (FGA) pentru musulmanii șiiți și de la 0,7152 (CSF1PO) la 0,9120 (D18S51) pentru musulmanii suniți. Heterozigozitatea observată (H(o)) a variat de la 0,5833 (D18S51) la 0,8595 (VWA) la musulmanii șiiți și de la 0,6818 (CSF1PO) la 0,8333 (D21S11) la musulmanii suniți și a fost mai mică decât heterozigozitatea așteptată (H(e)) pentru 11 din cele 15 STR-uri tipizate. Am analizat afinitățile genetice ale populațiilor de musulmani șiiți și sunniți cu populațiile din India de Nord, Orientul Mijlociu, Asia de Est și Europa, cele mai apropiate din punct de vedere geografic, folosind metode bazate pe distanțe, inclusiv arbori de îmbinare a vecinilor și scalare multidimensională. În plus, am estimat contribuția genetică a populațiilor parentale presupuse incluse în analiză la fondul genetic al musulmanilor șiiți și sunniți folosind analiza amestecului. Deși am observat un anumit grad de contribuție genetică din Iran la ambele populații musulmane, rezultatele analizelor filogenetice bazate pe STR-uri autosomale sugerează o înrudire genetică cu unele dintre populațiile religioase hinduse vecine cele mai apropiate din punct de vedere geografic.