A vízben lévő protozoonparaziták, mint a Cryptosporidium, Giardia, Entamoeba és Toxoplasma világszerte 1,7 milliárd hasmenéses esetért felelősek, ami az öt év alatti gyermekek körében a második leggyakoribb halálozási ok. Környezetre rezisztens ciszta/oocysta stádiumot mutatnak. Fontosságuk ellenére kimutatásuk standard analitikai módszerei még mindig immunvizsgálatra, majd mikroszkópos vizsgálatra épülnek. Az utóbbi években új módszerekről számoltak be, amelyek javíthatják a környezeti diagnosztikát. Ez az áttekintés a gyakori, vízben előforduló protozoon paraziták cisztáira és oocisztáira összpontosít, és megvizsgálja a környezetükben történő kimutatásukra szolgáló bioszenzorokat és nanotechnológiai alapú lehetőségeket. Részletesen ismertetjük az új fejlesztéseket, köztük az antitestek helyettesítésére szolgáló aptamereket, a szerves színezékek helyettesítésére szolgáló nanoanyagokat, valamint az olyan új jelzési módszerek kifejlesztését, mint a felülettel megerősített Raman-spektroszkópia és a cantilever-alapú tömegmérés. Néhány jövőbeli kutatási lehetőséget tárgyalnak az analitikai módszerek jelenlegi korlátainak kezelésére.