V této studii charakterizujeme genetickou diverzitu a vztahy mezi šíitskými a sunnitskými muslimskými populacemi severní Indie a geograficky zaměřenými sousedními a světovými populacemi. Zkoumali jsme řadu parametrů populačně genetického a forenzního zájmu na základě frekvencí alel z 15 autozomálních STR lokusů (D8S1179, D21S11, D7S820, CSF1PO, D19S433, VWA, TPOX, D18S51, D3S1358, THO1, D13S317, D16S539, D2S1338, D5S818 a FGA). Všechny studované lokusy odpovídaly Hardy-Weinbergově rovnováze, s výjimkou lokusů D18S51 a FGA pro obě muslimské populace, a to i po použití Bonferroniho korekce. Kombinovaná vylučovací síla a kombinovaná diskriminační síla pro všech 15 STR lokusů byla u obou muslimských populací 0,9999, respektive >0,99999. Hodnoty genové diverzity se pohybovaly od 0,6784 (TPOX) do 0,9027 (FGA) u šíitských muslimů a od 0,7152 (CSF1PO) do 0,9120 (D18S51) u sunnitských muslimů. Zjištěná heterozygotnost (H(o)) se pohybovala od 0,5833 (D18S51) do 0,8595 (VWA) u šíitských muslimů a od 0,6818 (CSF1PO) do 0,8333 (D21S11) u sunnitských muslimů a byla nižší než očekávaná heterozygotnost (H(e)) u 11 z 15 typizovaných STR. Analyzovali jsme genetickou příbuznost šíitských a sunnitských muslimských populací s jejich geograficky nejbližšími sousedními severoindickými, blízkovýchodními, východoasijskými a evropskými populacemi pomocí metod založených na vzdálenostech, včetně stromů spojování sousedů a vícerozměrného škálování. Kromě toho jsme odhadli genetický příspěvek domnělých rodičovských populací zahrnutých do analýzy ke genofondu šíitských a sunnitských muslimů pomocí analýzy příměsí. Přestože jsme zaznamenali určitý stupeň genetického příspěvku Íránu k oběma muslimským populacím, výsledky fylogenetických analýz založených na autozomálních STR naznačují genetickou příbuznost s některými geograficky nejbližšími sousedními hinduistickými náboženskými populacemi.