Radjput-flagga

För de muslimska invasionerna i norra Indien på 1000-talet styrdes Rajputana av ett antal lokala dynastier, främst av Gurjara Pratiharas, som styrde i Kanauj; Paramaras i Malwa, Chauhans i Ajmer, Bamraulia i Dholpur, Chaulukya (Solankis) i Anhilwara i Gujarat, Guhilots med Sisodia i Udaipur (Mewar), Rathores i Marwar (Jodhpur) och Kachwaha-klanen i Jaipur. Rathore, Chauhan, Sisodia och Kachwahas regerade fram till Indiens självständighet. Dessa Rajput-dynastier blev gradvis ersatta eller underordnade av de muslimska inkräktarna på 1000-talet och försvagades av interna fejder. I början av 1500-talet började Rajputmakten återuppstå, men störtades av Babur, grundaren av mogulriket, vid Fatehpur Sikri 1527. Klanerna erövrades, överrumplades eller försonades slutligen av Akbar, med undantag för den avlägsna Sisodia-klanen, som dock underkastade sig Jahangir 1616. Från Jahangirs tillträde till Aurangzebs död 1707, en period på 100 år, var större delen av Nordindien under mogulernas kontroll, även om vissa stater gjorde uppror, t.ex. Bundelas mot Shah Jahan, Mewar och Marwar mot Aurangzeb. På 1500-talet ökade Jats makt och de kämpade mot Aurangzeb i slaget vid Tilpat. Efter Gokula Singhs död plundrade Raja Ram Jat Akbars grav och grävde upp Akbars ben och brände dem. Aurangzebs död, marathanernas invasion och Nader Shah av Iran ledde till en trippelallians mellan de tre ledande Rajputhövdingarna, vars interna avundsjuka försvagades så mycket att marathanerna, som hade kallats in av raathorerna för att hjälpa dem, tog Ajmer i besittning omkring 1756. I slutet av århundradet hade nästan hela östra Rajputana praktiskt taget underkuvats av maraterna. Det andra anglo-marathakriget distraherade maraterna från 1807 till 1809, men därefter återupptogs marataternas herravälde över Rajputana. År 1817 gick britterna i krig mot Pindaris, plundrare som var baserade på Marataterritorium, vilket snabbt blev det tredje anglo-marathakriget, och den brittiska regeringen erbjöd sitt skydd till Rajput-herrarna mot Pindaris och Marathas. Pindaris besegrades, och den afghanska äventyraren Amir Khan underkastade sig och undertecknade ett fördrag med britterna, vilket gjorde honom till härskare över Tonk. I slutet av 1818 hade liknande fördrag ingåtts mellan de andra Rajputstaterna och Storbritannien. Maratha Sindhia-härskaren i Gwalior gav upp distriktet Ajmer-Merwara till britterna, och Maratha-inflytandet i Rajasthan upphörde. De flesta av Jat- och Rajputprinsarna förblev lojala mot Storbritannien under revolten 1857, och få politiska förändringar genomfördes i Rajputana fram till Indiens självständighet 1947.