Protein är involverat i skapandet av vissa hormoner. Dessa ämnen hjälper till att kontrollera kroppsfunktioner som involverar samverkan mellan flera organ. Insulin, ett litet protein, är ett exempel på ett hormon som reglerar blodsockret. Det involverar samverkan mellan organ som bukspottkörteln och levern. Sekretin, är ett annat exempel på ett proteinhormon. Detta ämne hjälper till i matsmältningsprocessen genom att stimulera bukspottkörteln och tarmen att skapa nödvändiga matsmältningssafter.EnzymerEnzymer är proteiner som ökar hastigheten på kemiska reaktioner i kroppen. Faktum är att de flesta av de nödvändiga kemiska reaktionerna i kroppen inte skulle kunna genomföras effektivt utan enzymer. En typ av enzym fungerar till exempel som ett hjälpmedel för att smälta stora protein-, kolhydrat- och fettmolekyler till mindre molekyler, medan ett annat hjälper till att skapa DNA.Transport och lagring av molekylerProtein är en viktig del av transporten av vissa molekyler. Hemoglobin är till exempel ett protein som transporterar syre genom hela kroppen. Protein används också ibland för att lagra vissa molekyler. Ferritin är ett exempel på ett protein som kombineras med järn för lagring i levern.AntikropparProtein bildar antikroppar som hjälper till att förebygga infektioner, sjukdomar och ohälsa. Dessa proteiner identifierar och hjälper till att förstöra antigener som bakterier och virus. De arbetar ofta tillsammans med övriga celler i immunförsvaret. Dessa antikroppar identifierar till exempel antigener och omger dem sedan för att hålla dem instängda tills de kan förstöras av vita blodkroppar.