Reprodução pode ser muito variada devido a múltiplos organismos diferentes neste filo. A reprodução ocorre primeiro entre dois sexos opostos. Uma fêmea porá o óvulo e o macho fertilizará com os espermatozóides. Mas alguns moluscos são hermafroditas, por isso têm tanto o sistema reprodutivo masculino como o feminino. As lesmas e ostras marinhas podem mudar repetidamente o seu sexo para proteger a criança.
Fertilização pode ocorrer externa ou internamente. A reprodução externa ocorre mais entre os moluscos aquáticos. Os moluscos machos e fêmeas irão ejetar seu óvulo ou esperma na água e a fertilização e desenvolvimento começa. Dentro de 2-3 semanas o óvulo eclodirá em uma larva conhecida como trocóforo. Os trocóforos têm a forma de uma pêra esférica e estão rodeados de cílios. Eles usam os cílios para varrer em partículas de alimento flutuantes. Após o estágio de trocóforo, eles se desenvolvem em larvas de veliger e se formam em velum. O velino é usado para nadar, alimentar-se e trocar gases. Nesta fase, eles também começam a desenvolver um pé. Esta é também a fase em que eles desenvolvem suas características adultas, e são conhecidos como adultos em miniatura.
alguns outros moluscos reproduzem-se internamente, como os caramujos terrestres. A fertilização ocorre na fêmea quando o esperma do macho fertilizou com sucesso o óvulo. Para algumas espécies, quando o óvulo é fertilizado, a fêmea deposita o óvulo na água. Uma larva ou um adulto em miniatura é formado quando eclodem. Estas larvas experimentarão os mesmos estágios que as larvas desenvolvidas através da reprodução externa, trocóforo e veludo. Nos outros moluscos, os ovos fertilizados permanecem dentro da fêmea onde estão completamente desenvolvidos e depois nascem.