A distância da vista pública, a inovação científica mais conseqüente durante a Segunda Guerra Mundial foi a criação da bomba atômica através do Projeto Manhattan ultra-secreto. Inspirado por cientistas refugiados da Europa, incluindo Albert Einstein e Leo Szilard, supervisionado pelo Corpo de Engenheiros do Exército dos EUA sob o comando do General Leslie Groves, e com o Dr. Robert Oppenheimer liderando a equipe científica, os Estados Unidos se engajaram em uma corrida secreta para produzir uma arma atômica diante dos nazistas. Sob o Projeto Manhattan, os militares americanos operaram plantas secretas em Oak Ridge, Tennessee, e Hanford, Washington, para produzir os elementos necessários de urânio e plutônio necessários para uma bomba. Isolados no remoto Los Alamos, Novo México, uma tremenda equipe de físicos trabalhou para criar um sistema de detonação viável. O projeto de 2 bilhões de dólares empregou mais de 125.000 pessoas em toda a América, a maioria das quais não tinha idéia no que estavam trabalhando, e acabou levando ao dramático teste da Trindade no deserto do Novo México em julho de 1945, deixando os Estados Unidos para enfrentar a questão: a bomba atômica era uma arma suficiente para pôr fim à Segunda Guerra Mundial?