Mycoses cutanées chez les riziculteurs de l’État d’Anambra, au Nigeria

Abstract

Le grain de riz est l’une des cultures alimentaires les plus importantes au monde, et sa culture est une occupation majeure dans l’État d’Anambra, au Nigeria. Ces riziculteurs sont exposés à divers agents qui les prédisposent aux mycoses cutanées. L’objectif de ce travail était de dépister chez les riziculteurs des lésions évocatrices de mycoses cutanées et d’isoler et identifier les agents fongiques associés à l’infection. Cette enquête a été réalisée entre novembre 2009 et juin 2011 dans l’État d’Anambra, au Nigeria. Les échantillons cliniques recueillis auprès de 201 agriculteurs présentant des lésions évocatrices de mycoses cutanées ont été traités et les organismes identifiés. Des questionnaires ont été utilisés pour obtenir les autres données nécessaires et ont été analysés statistiquement. Sur les 2 580 riziculteurs examinés, 201 (7,79 %) présentaient des lésions positives. Les organismes retrouvés étaient Microsporum audouinii, Microsporum ferrugineum, Trichophyton megnini, Trichophyton tonsurans, Trichophyton rubrum, Aspergillus terrus, Aspergillus candidus, Aspergillus scleriotorum, Aspergillus niger, Aspergillus flavus, Scopulariopsis sp, Chrysosporium sp., Eupenicillium javanicum, Fusarium sp., Penicillium aculeatum, et Penicillium pinophilum. Au terme de ce travail, il a été observé que l’onychomycose est la plus répandue, les moisissures non dermatophytes devenant désormais des agents très importants des mycoses cutanées chez le riziculteur.

1. Introduction

La riziculture est l’une des principales occupations dans la partie nord de l’État d’Anambra, au Nigeria. Cette céréale qui est l’une des cultures alimentaires les plus importantes du monde est cultivée soit dans des zones marécageuses de basse altitude avec beaucoup d’eau, soit sur un plateau ou dans des régions vallonnées où les précipitations naturelles fournissent une quantité d’eau suffisante . La préparation de la terre, le labourage du champ, l’utilisation de fumier, d’engrais, de pesticides et d’herbicides, le semis des graines de riz, le repiquage des plants de riz et la récolte sont effectués manuellement par ces agriculteurs ce qui les prédispose aux mycoses cutanées.

Les mycoses cutanées sont des infections fongiques pathogènes qui affectent les couches kératinisées de la peau et de ses annexes (ongle, cheveux). Elles n’affectent pas les tissus vivants. Ces infections sont principalement causées par des dermatophytes et des levures. En plus des pathogènes reconnus, les moisissures non dermatophytes deviennent maintenant significatives dans les mycoses cutanées.

Il a été rapporté une augmentation effrayante de l’incidence des infections fongiques ces derniers temps. Terrell , Meis et Verweij , et Rolston ont établi un lien entre ces infections et les traitements médicaux, les conditions d’immunodépression, la malnutrition, certaines opérations chirurgicales et les métaux lourds comme le mercure. Selon Gugnani , Shenoi et al. et Oyeka et Eze, d’autres facteurs peuvent prédisposer aux infections fongiques, notamment l’hygiène personnelle, la promiscuité et les mauvaises conditions sanitaires, la taille de la famille, l’âge, le climat chaud et humide, le statut socio-économique et les voyages internationaux. Les travailleurs agricoles qui sont exposés à divers agents irritants, à savoir la boue, la bouse de vache ou d’autres types de fumier, les engrais, les herbicides, les pesticides, la poussière et le sol (qui est considéré comme un réservoir de la plupart des organismes pathogènes, y compris les champignons dermatophytes et non dermatophytes) sont également prédisposés à l’infection fongique.

Les infections fongiques causées par les moisissures dermatophytes et non dermatophytes ont été largement signalées comme un problème de santé publique au Nigeria et dans le monde entier . Cependant, on ne peut pas encore trop insister sur ce point car la nature contagieuse parmi les communautés animales, le coût élevé du traitement, la difficulté du contrôle et les conséquences sur la santé publique expliquent leur grande importance . Par conséquent, cette étude a été conçue pour rapporter les moisissures dermatophytes et non dermatophytes associées aux mycoses cutanées chez les riziculteurs de l’État d’Anambra, au Nigeria.

2. Matériaux et méthode

Deux mille cinq cent quatre-vingts (2 580) riziculteurs, y compris des adultes et des enfants, ont été dépistés pour des lésions évocatrices de mycoses cutanées. Les lésions ont été évaluées en fonction des démangeaisons, de la desquamation, de la fissuration, de la rougeur de la peau et de la dystrophie des ongles. Des questionnaires ont été utilisés pour obtenir des informations sur le sexe, l’âge, la localisation de la lésion, le niveau d’éducation, la taille de la famille, la nature du logement des familles, la présence d’animaux de compagnie/domestiques dans la maison, et la durée de la lésion, si l’agriculteur utilise du fumier, des engrais, des herbicides ou des pesticides.

2.1. Prélèvement d’échantillons cliniques

Les lésions ont été nettoyées avec de l’alcool à 70%, et des raclages ont été prélevés de manière aseptique près des bords avancés de ces lésions avec un scalpel stérile. Les échantillons d’ongles des doigts et des orteils ont été prélevés à l’aide de pinces à ongles après que les ongles aient été nettoyés avec de l’alcool à 70 %. Les échantillons ont été recueillis dans des poches d’échantillonnage, transférés au laboratoire de microbiologie de l’Université Nnamdi Azikiwe, Awka, Nigéria, et traités dans les 2 h. Des écouvillons ont également été recueillis sur la toile des orteils/doigts après avoir été nettoyés avec de l’alcool à 70 % à l’aide d’un bâtonnet stérile.

2.2. Traitement des spécimens

Des lames de microscopie directe ont été préparées avec du KOH à 20 % pour certaines portions de raclages de peau et de coupures d’ongles. Les portions restantes et les écouvillons d’orteils/de doigts ont été inoculés dans des plaques en double contenant de la Sabouraud Dextrose Agar (SDA) (Biotech) complétée par 0,05 mg/mL de chloramphénicol et 0,5 mg/mL de cycloheximide. Une autre plaque en double contenant 0,05 mg/mL de chloramphénicol seul a également été inoculée avec l’échantillon. Les plaques ont été incubées à 27°C pendant 4 semaines. Les plaques positives avec une croissance fongique ont été purifiées en subculturant les différentes colonies dans des slants SDA frais sans antibiotiques.

2.3. Identification des isolats

Les isolats ont été identifiés sur la base d’une étude détaillée de leurs morphologies macroscopiques et microscopiques et comparés à la description standard donnée par Campbell et Stewart , Guy St-Germain et Richard , et De Hoog et al . Dix des isolats ont été identifiés à l’aide du séquençage de la région espaceur transcrit interne de l’ADN ribosomal de l’isolat au Nationales Konsiliarlabor für Dermatophyten, Institut für Mikrobiologie und Hygiene, Charité-Universitatmedizin, Berlin, Allemagne.

2.4. Analyse statistique

Les résultats et les données obtenus à partir du questionnaire distribué aux riziculteurs touchés ont été analysés statistiquement à l’aide des tests du chi carré, de Kruskal-Wallis et de Mann-Whitney. Les résultats ont été testés pour un niveau significatif de 0,05.

3. Résultats

Sur un total de 2580 agriculteurs dépistés pour des infections cutanées, 201 (7,79%) personnes ont présenté des lésions évocatrices d’une infection fongique. Les échantillons prélevés étaient positifs par KOH et par culture. Le montage KOH a montré des fragments d’hyphes septés dans certains échantillons et non septés dans d’autres. Parmi la population étudiée présentant une infection cutanée, 78 (38,81%) étaient des hommes, tandis que 123 (61,19%) étaient des femmes. Quatre-vingt-dix (44,78 %) des 201 échantillons provenaient d’une infection des ongles des doigts, 45 (22,39 %) d’une infection des ongles des orteils, 27 (13,43 %) d’une infection de la peau glabre, 20 (9,95 %) d’une infection des pieds, 12 (5,97 %) d’une infection de la toile des doigts/des orteils et 7 (3,48 %) d’une infection du cuir chevelu. Le tableau 1 montre la répartition des mycoses cutanées selon le site d’infection, le sexe et l’âge des riziculteurs. L’analyse des cas d’infection en fonction de l’âge des riziculteurs a montré que l’infection était statistiquement significative avec l’âge () et était enregistrée davantage dans le groupe d’âge 16-30 ans (47,76%), suivi du groupe d’âge 31-45 ans (35,82%) (Tableau 1). L’infection a également été signalée davantage chez les familles vivant dans des logements surpeuplés (), les agriculteurs qui partageaient des installations () et ceux qui gardaient des animaux de compagnie/domestiques ().

Un total de 225 isolats fongiques, comprenant 48 (21,33%) dermatophytes (tableau 2) et 177 (78,67%) moisissures non dermatophytes (tableau 3) ont été récupérés à partir des échantillons. T. rubrum (11,11 %) et A. candidus (16,44 %) étaient les moisissures dermatophytes et non dermatophytes les plus fréquemment isolées, respectivement. Les isolats identifiés au Nationales Konsiliarlabor für Dermatophyten, Institut für Mikrobiologie und Hygiene, Charité-Universitatmedizin, Berlin, Allemagne, appartenaient aux espèces Aspergillus scleriotorum, Aspergillus flavus, Aspergillus terrus, Eupenicillium javanicum, Penicillium aculeatum, Penicillium pinophilum et Fusarium.

4. Discussion

La présente étude sert à souligner l’importance de la santé publique de l’infection fongique chez les riziculteurs dans l’État d’Anambra, au Nigeria. L’infection des ongles des doigts et des orteils était plus importante que celle des autres parties du corps et plus prévalente chez les femmes. La prévalence plus élevée de cette infection chez les femmes peut être attribuée au fait qu’elles utilisent davantage leurs doigts que les hommes pour la culture et la récolte du riz. Ceci concorde avec les rapports d’El Sayed et al. et de Souza et al. . Souza et al. ont rapporté que 72,25 % des cas d’onychomycose de leur étude au Japon étaient des femmes, tandis que Kazemi et Charles ont rapporté une prévalence plus élevée de cette infection chez les hommes, même si leurs études ne portaient pas sur des riziculteurs. Ceci est également confirmé par les résultats de Blank et al. et de Shenoi et al. qui ont rapporté un taux élevé d’infection des ongles chez les travailleurs des rizières en Inde.

L’infection du cuir chevelu n’a été observée que chez les enfants et pourrait probablement avoir été transmise par les mains infectées de leurs mères et d’autres relations. Les hommes (71,43%) avaient plus d’infection que les femmes (28,57%). Oyeka a fait la même observation et l’a liée à la faible hygiène personnelle des hommes par rapport à leurs homologues féminins.

Les agriculteurs de la tranche d’âge 16-30 ans ont enregistré plus d’infections que les autres groupes d’âge et cela pourrait s’expliquer par le fait que ce groupe d’âge est plus activement impliqué dans la riziculture que les groupes d’âge plus jeunes et plus âgés et a tendance à transpirer davantage.

La transmissibilité des infections fongiques parmi les membres de la famille a été largement rapportée au Nigeria et soutient les résultats de cette étude où un taux d’infection plus élevé a été rapporté parmi les familles vivant dans des logements surpeuplés (), celles qui partageaient des installations () et celles qui gardaient des animaux de compagnie/domestiques (). Ces installations et ces animaux peuvent agir comme des réservoirs de champignons/spores par lesquels l’infection peut facilement être transférée aux agriculteurs.

Une observation importante faite au cours de cette étude est que les riziculteurs n’utilisent ni bottes ni gants de main pendant leurs travaux agricoles, car les bottes s’enfoncent dans la boue et réduisent leur vitesse de travail selon ces agriculteurs. La non-utilisation de vêtements de protection des pieds et des mains expose ces agriculteurs aux agents infectieux. Une observation similaire a été faite par Shenoi et al. On a également observé une mauvaise hygiène personnelle chez ces agriculteurs qui est un facteur connu pour prédisposer les personnes à toutes sortes d’infections, y compris les infections fongiques .

Trichophyton rubrum était le dermatophyte le plus fréquemment retrouvé (11,11%) dans cette étude. C’était le seul organisme fongique retrouvé sur toutes les parties du corps, à l’exception de la bande des doigts et des orteils. Ces résultats concordent avec les travaux d’autres chercheurs qui ont signalé que T. rubrum était l’agent étiologique le plus courant des dermatophytoses de différentes parties du corps. Cette étude a également démontré qu’en plus des dermatophytes responsables des infections fongiques cutanées, les moisissures non dermatophytes deviennent des agents étiologiques très importants des infections cutanées. Dans cette étude, les moisissures non dermatophytes ont été plus fréquemment isolées (78,67 %) que les dermatophytes habituels (31,33 %), en particulier dans l’onychomycose. Bien que certains chercheurs aient rapporté que les dermatophytes représentaient la majorité des cas d’onychomycose, des études épidémiologiques ont également montré qu’Aspergillus sp. sont des agents fongiques émergents de l’onychomycose des ongles des orteils. Il est maintenant classé deuxième après Scopulariopsis sp. et ensuite Fusarium solani dans les onychomycoses non dermatophytes. Aspergillus sp. était la moisissure non dermatophyte la plus isolée dans cette étude, suivie de Scopulariopsis sp. et ensuite de Chrysosporium sp. ; Penicillium pinophilum, Penicillium aculeatum, et Eupenicillium javanicum qui ont été isolés dans ce travail n’avaient pas, selon la littérature, été impliqués dans des infections cutanées. Ils ont été signalés comme étant fréquemment isolés du sol et sont impliqués dans la production et la saccharification de différentes enzymes industrielles comme la B-D-mannase, l’endoglucanase, la -glucosidase et la pectinase, ainsi que dans la saccharification des polysaccharides de la paille d’orge, d’avoine et de blé, et du Solka-Floc . La capacité de ces organismes à produire les enzymes susmentionnées pourrait expliquer leur aptitude à dégrader également les zones kératinisées de la peau. La fréquence élevée d’isolement des moisissures non dermatophytes observée dans cette étude pourrait être attribuée à leur isolement régulier de l’eau, de l’air, du sol et de la végétation, comme l’ont constaté Oyeka et Okoli et Cribier et Bakshi . Cela rend leurs chances d’entrer en contact avec la peau humaine élevées, donnant lieu à une infection opportuniste.

5. Conclusion

Au terme de cette étude, il a été observé que la mycose cutanée des ongles était la plus fréquente. Il faut donc veiller à contrôler la propagation de cette infection puisque ces agriculteurs partagent les services publics avec la masse. Il a également été noté qu’en plus des dermatophytes, les moisissures non dermatophytes sont maintenant des agents étiologiques très importants de l’infection cutanée, en particulier dans l’onychomycose. D’autres tests seront effectués pour déterminer le pouvoir pathogène de Penicillium pinophilum, Penicillium aculeatum et Eupenicillium javanicum récupérés dans ce travail.

Reconnaissance

Les auteurs souhaitent remercier le Dr Yvonne Graeser du Nationales Konsiliarlabor für Dermatophyten, Institut für Mikrobiologie und Hygiene, Charité-Universitatsmedizin, Berlin, Allemagne, qui a aidé à identifier les isolats fongiques.