Aivojen hypotalamuksen alueella sijaitseva suprachiasmaattinen ydin sisältää kehon pääkellon. Se synkronoi sisäisen vuorokausirytmin ulkoisen päivä- ja yösyklin antamiin ympäristövihjeisiin. Tarkemmin sanottuna se käyttää valoa ja valon puutetta tähän synkronointiin. Pääkello synkronoi vuorokausirytmin sekä elin- että solutasolla. Se, miten valo vaikuttaa ihmiskehoon, riippuu valolle altistumisen ajoituksesta ja kestosta, kirkkaudesta sekä valon spektrisestä sisällöstä. Sirkadiaaninen rytmi vaikuttaa moniin elimistön prosesseihin, kuten aineenvaihduntaan, immuunijärjestelmän toimintaan, uneen ja muihin käyttäytymiseen ja mielialaan liittyviin seikkoihin. Pääkello saa syötteitä yksinomaan silmän ipRGC:ltä. Näihin soluihin vaikuttaa pääasiassa sininen valo suurilla intensiteeteillä, vaikka ne saavat tietoa myös muilta aallonpituuksilta sauvojen ja käpyjen kanssa olevien yhteyksien kautta.

Valolle, erityisesti sinisille aallonpituuksille, altistuminen epäsopivassa vuorokausivaiheessa johtaa vuorokausirytmin häiriöihin ja niihin liittyviin terveys- ja käyttäytymisvaikutuksiin. Yhä useammin ympärivuorokautinen elämäntapamme muuttaa valolle altistumisen mallejamme ja haastaa suoraan vuorokausirytmimme yöunille. Altistuminen sinisille aallonpituuksille illalla, myös kotien valaistuksesta ja valoa lähettävistä näytöistä, viivästyttää vuorokausikelloa. Tämä häiriö vaikeuttaa nukahtamista yöllä, heräämistä aamulla ja heikentää tarkkaavaisuuskykyä seuraavana aamuna.

Vuorotyö johtaa siihen, että ihmiset nukkuvat ja työskentelevät epäoptimaalisiin vuorokaudenaikoihin. Tämä johtaa huonompaan uneen ja terveyteen, heikompaan tuottavuuteen ja lisääntyneeseen virheiden ja onnettomuuksien riskiin. Vuorotyö on eräänlainen ei-vapaaehtoinen vuorokausivirhe, kun taas sosiaalinen jet lag on vapaaehtoinen. Sosiaalinen jetlag, joka on ero unirytmissä arkipäivien ja viikonloppujen välillä, johtaa sirkadiaaniseen virheasentoon auringon syklin kanssa, koska elimistö saa epäjohdonmukaista altistumista päivänvalolle ja valolle yöllä.

Se, että sirkadiaaninen järjestelmä sopeutuu valoaltistukseen, on hyvä asia. Se tarkoittaa, että elimistö voi sopeutua vuoden aikana muuttuvaan päivä- ja yösykliin, mutta myös sitä, että voimme sopeutua jetlagiin, jota koemme matkustaessamme eri aikavyöhykkeiden välillä. Nämä sopeutumiset uuteen ympäristöön ovat kuitenkin hitaita. Päivän pituus muuttuu tyypillisesti vain muutaman minuutin päivässä, ja sopeutuminen uusiin aikavyöhykkeisiin kestää useita päiviä. Näyttää siltä, että on huono asia olla jatkuvasti pois vaiheesta vuorokausivaiheen suhteen. Vaikuttaa siltä, että terveyden kannalta ei ole juurikaan merkitystä sillä, onko heräämis- ja unijakson jatkuva siirtyminen väärään suuntaan vai onko heräämis- ja unijakson jatkuva siirtyminen väärään suuntaan.

Se, että sirkadiaaninen rytmi sopeutuu uuteen ympäristöön, on jotakin, mitä voimme käyttää hyväksi saadaksemme paremman sirkadiaanisen linjauksen. Rytmiä voidaan vahvistaa sopivaan aikaan sinisellä rikastetulla valkoisella valolla vireystilan, suorituskyvyn, mielialan ja unen laadun parantamiseksi. Luonnollinen altistuminen auringon siniselle valolle päivän aikana on hyvä tapa saavuttaa tämä. Sinisen valon voimakkuus on suurimmillaan keskipäivän aikaan. Altistuminen siniselle valolle aamulla aikaistaa vuorokausikelloa. Tämä auttaa ihmisiä, jotka haluavat siirtää nukkumisensa aikaisempaan aikaan. Ulkoilu, kuten retkeily luonnonvalossa, voi lisätä altistumista voimakkaalle valolle päivän aikana ja kalibroida vuorokausirytmin uudelleen. Altistuminen kirkkaalle päivänvalolle voi myös vähentää vuorokausijärjestelmän herkkyyttä valolle altistumiselle yöllä verrattuna niihin, jotka kokevat hämärää päivänvaloa ja joilla on minimaalinen ulkoilmavalokontakti.

Kuten edellä mainittiin, ihmisten ikääntyessä verkkokalvolle välittyy vähemmän sinistä valoa. Tämän alhaisemman lähetystason päivällä uskotaan vaikuttavan kielteisesti ikääntyneiden ihmisten uneen. Iäkkäät ihmiset tarvitsevat yleensä voimakkaampia signaaleja pääkellon nollaamiseksi. Nuoremmat ihmiset ovat kuitenkin herkempiä siniselle valolle ja asettavat vuorokausirytmin helpommin.

Yhtä tärkeää kuin saada kirkasta valoa päivällä on, että on pimeää yöllä. Toistuvien kylläisen sinisen valon (480 nm) välähdysten sirkadiaanisen yön aikana, jopa suljettujen silmäluomien läpi annettuna, on osoitettu siirtävän ihmisen sirkadiaanista kelloa. Sininen ja vihreä valo yöllä vaikuttavat unen laatuun ja vähentävät melatoniinin tuotantoa. Melatoniini on erittäin voimakas antioksidantti, joka auttaa mitokondrioiden korjaamisessa nukkuessasi.