Alle aminosyrer undergår ændringer i ladning under forskellige fysiologiske forhold, almindeligvis eksemplificeret ved pH. I grove træk bliver både amino- og carboxylrester samt sidekæderne i alle aminosyrer under sure forhold protoneret, hvilket genererer en positiv ladning af forskellig styrke afhængigt af aminosyren. Når pH-værdien stiger, deprotoneres aminosyrerne med forskellige hastigheder (hastighederne bestemmes af offentliggjorte syredissociationskonstanter, Ka; -log(Ka)=pKa, pKa-værdier anvendes hyppigst, da de er kompatible med pH-skalaen)

Især histidin har en basisk sidekæde. Selv om det kan lyde kontraintuitivt, betyder det, at det kan stabilisere en positiv ladning gennem resonans ved pH-værdier, der er lavere end deres pKa. Kort sagt bevarer histidin sin positive ladning indtil systemets pH>6. Over denne pH er histidin neutralt ladet til et vist punkt. Når pH-værdien bliver basisk nok, bliver aminosyren deprotoneret igen og bliver negativt ladet. Se på aminosyresyre-dissociationskonstanter for at få mere at vide om denne proces. Ret enkelt i et diagram, sværere at beskrive med ord. Håber det hjalp!