Protein er involveret i dannelsen af nogle hormoner. Disse stoffer er med til at kontrollere kropsfunktioner, der involverer samspillet mellem flere organer. Insulin, et lille protein, er et eksempel på et hormon, der regulerer blodsukkeret. Det involverer et samspil mellem organer som bugspytkirtlen og leveren. Sekretin, er et andet eksempel på et proteinhormon. Dette stof hjælper med fordøjelsesprocessen ved at stimulere bugspytkirtlen og tarmen til at skabe de nødvendige fordøjelsessafter.EnzymerEnzymerEnzymer er proteiner, der øger hastigheden af kemiske reaktioner i kroppen. Faktisk ville de fleste af de nødvendige kemiske reaktioner i kroppen ikke kunne foregå effektivt uden enzymer. For eksempel fungerer en type enzym som hjælp til at fordøje store protein-, kulhydrat- og fedtmolekyler til mindre molekyler, mens en anden type enzym hjælper med at danne DNA.Transport og lagring af molekylerProtein er et vigtigt element i transporten af visse molekyler. For eksempel er hæmoglobin et protein, der transporterer ilt i hele kroppen. Protein bruges også nogle gange til at lagre visse molekyler. Ferritin er et eksempel på et protein, der kombineres med jern til opbevaring i leveren.AntistofferProtein danner antistoffer, der hjælper med at forebygge infektion, sygdom og sygdom. Disse proteiner identificerer og hjælper med at ødelægge antigener som f.eks. bakterier og vira. De arbejder ofte sammen med de andre celler i immunsystemet. For eksempel identificerer disse antistoffer antigener og omgiver dem derefter for at holde dem indesluttet, indtil de kan ødelægges af hvide blodlegemer.